Acusado de los delitos de Incumplimiento de Deberes y Falsedad Documental Agravada cometidos en el ejercicio de sus funciones como presidente de Corte de Cuentas de la República CCR, la Fiscalía General de la República (FGR) presentó requerimiento fiscal contra Rafael Hernán Contreras Rodríguez, en el juzgado Octavo de Paz de San Salvador.
German Arriaza, Director Anticorrupción y contra la Impunidad de la FGR, explicó que Hernán Contreras «favoreció a Elías Antonio Saca al ordenar una auditoría irregular a la Partida Secreta del expresidente de la República».
En el juicio realizado en 2018 cuando el propio Elías Antonio Saca se declaró culpable de los delitos de Corrupción, reconoció que la Corte de Cuentas de la República durante su mandato presidencial «solamente realizaba exámenes superficiales al manejo de fondos de Casa Presidencial», desde ese entonces la Fiscalía inició una investigación contra el expresidente de la Corte de Cuentas, Hernán Contreras.